Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3TTJ4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q3TTJ4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3TTJ4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3TTJ4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3TTJ4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TTJ4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TTJ4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q3TTJ4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3TTJ4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTJ4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTJ4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTJ4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTJ4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTJ4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTJ4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3TTJ4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3TTJ4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTJ4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTJ4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTJ4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTJ4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTJ4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTJ4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3TTJ4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3TTJ4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.8 ms