Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eepd1Q3TGW2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eepd1Q3TGW2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eepd1Q3TGW2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms