Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q08AU9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q08AU9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q08AU9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q08AU9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q08AU9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q08AU9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q08AU9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q08AU9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q08AU9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q08AU9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q08AU9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q08AU9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q08AU9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q08AU9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q08AU9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q08AU9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q08AU9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q08AU9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q08AU9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q08AU9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q08AU9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q08AU9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q08AU9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q08AU9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q08AU9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q08AU9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q08AU9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q08AU9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q08AU9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q08AU9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q08AU9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q08AU9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms