Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssrp1Q08943 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssrp1Q08943 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssrp1Q08943 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms