Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tgm3Q08189 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tgm3Q08189 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms