Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcr5Q04683 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr5Q04683 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr5Q04683 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms