Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mmp11Q02853 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mmp11Q02853 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms