Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd1Q02242 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd1Q02242 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms