Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxd1Q01822 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd1Q01822 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd1Q01822 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms