Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp4Q00724 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms