Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabpaQ00422 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms