Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SmsP97355 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SmsP97355 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SmsP97355 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SmsP97355 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SmsP97355 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SmsP97355 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SmsP97355 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SmsP97355 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SmsP97355 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SmsP97355 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SmsP97355 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SmsP97355 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SmsP97355 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SmsP97355 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SmsP97355 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SmsP97355 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SmsP97355 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SmsP97355 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SmsP97355 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SmsP97355 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SmsP97355 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SmsP97355 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SmsP97355 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SmsP97355 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SmsP97355 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SmsP97355 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SmsP97355 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SmsP97355 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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SmsP97355 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SmsP97355 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms