Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabpb2P81069 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms