Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptprn2P80560 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptprn2P80560 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptprn2P80560 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms