Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Ncoa1P70365 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncoa1P70365 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa1P70365 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms