Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msx3P70354 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx3P70354 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Msx3P70354 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx3P70354 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msx3P70354 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms