Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad54lP70270 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad54lP70270 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad54lP70270 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad54lP70270 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rad54lP70270 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rad54lP70270 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rad54lP70270 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms