Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrkcbP68404 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcbP68404 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms