Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra1P62812 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra1P62812 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms