Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms