Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps29P62274 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps29P62274 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps29P62274 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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