Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Depdc5P61460 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Depdc5P61460 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Depdc5P61460 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms