Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Polr3bP59470 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms