Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd4P58467 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Setd4P58467 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Setd4P58467 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Setd4P58467 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms