Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctbp2P56546 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctbp2P56546 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms