Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc12a1P55014 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc12a1P55014 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms