Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RabggtbP53612 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms