Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Polr1cP52432 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Polr1cP52432 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms