Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CitP49025 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CitP49025 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CitP49025 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CitP49025 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CitP49025 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CitP49025 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CitP49025 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CitP49025 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CitP49025 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CitP49025 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CitP49025 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CitP49025 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CitP49025 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CitP49025 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CitP49025 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CitP49025 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CitP49025 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CitP49025 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CitP49025 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CitP49025 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms