Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atoh1P48985 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atoh1P48985 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh1P48985 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms