Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrprbP47758 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrprbP47758 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrprbP47758 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrprbP47758 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SrprbP47758 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrprbP47758 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrprbP47758 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms