Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkx2-2P42586 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nkx2-2P42586 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms