Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ThpoP40226 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ThpoP40226 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ThpoP40226 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ThpoP40226 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ThpoP40226 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ThpoP40226 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms