Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd1P40201 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Chd1P40201 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd1P40201 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd1P40201 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd1P40201 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Chd1P40201 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Chd1P40201 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms