Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf1P39428 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf1P39428 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf1P39428 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf1P39428 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf1P39428 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf1P39428 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf1P39428 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf1P39428 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms