Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig1P37913 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig1P37913 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig1P37913 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lig1P37913 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lig1P37913 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lig1P37913 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms