Protein–RNA interactions for Protein: P35831

Ptpn12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn12P35831 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpn12P35831 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptpn12P35831 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms