Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddit3P35639 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddit3P35639 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddit3P35639 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms