Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TpoP35419 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TpoP35419 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TpoP35419 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TpoP35419 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TpoP35419 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TpoP35419 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TpoP35419 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TpoP35419 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TpoP35419 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TpoP35419 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms