Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola1P33609 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pola1P33609 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pola1P33609 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pola1P33609 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pola1P33609 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms