Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nedd8P29595 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms