Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RxraP28700 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RxraP28700 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RxraP28700 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RxraP28700 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RxraP28700 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RxraP28700 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RxraP28700 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RxraP28700 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RxraP28700 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RxraP28700 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RxraP28700 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RxraP28700 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RxraP28700 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RxraP28700 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RxraP28700 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RxraP28700 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RxraP28700 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RxraP28700 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RxraP28700 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RxraP28700 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RxraP28700 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RxraP28700 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
RxraP28700 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RxraP28700 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RxraP28700 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RxraP28700 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RxraP28700 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RxraP28700 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RxraP28700 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RxraP28700 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RxraP28700 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RxraP28700 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RxraP28700 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RxraP28700 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RxraP28700 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RxraP28700 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RxraP28700 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RxraP28700 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RxraP28700 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RxraP28700 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RxraP28700 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RxraP28700 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RxraP28700 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms