Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NapbP28663 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NapbP28663 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NapbP28663 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapbP28663 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapbP28663 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapbP28663 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NapbP28663 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NapbP28663 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NapbP28663 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NapbP28663 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NapbP28663 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NapbP28663 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NapbP28663 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapbP28663 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapbP28663 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapbP28663 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapbP28663 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapbP28663 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NapbP28663 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NapbP28663 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NapbP28663 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NapbP28663 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NapbP28663 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NapbP28663 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NapbP28663 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NapbP28663 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NapbP28663 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapbP28663 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NapbP28663 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapbP28663 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NapbP28663 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms