Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc6a9P28571 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms