Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpbP27790 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CenpbP27790 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpbP27790 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpbP27790 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CenpbP27790 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CenpbP27790 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms