Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctnna1P26231 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctnna1P26231 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctnna1P26231 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms