Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk11bP24788 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk11bP24788 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Cdk11bP24788 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms