Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd3eP22646 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd3eP22646 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms