Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cox5bP19536 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cox5bP19536 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cox5bP19536 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms