Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a1P19437 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a1P19437 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a1P19437 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms